ヒートマップ作り方

各行が遺伝子名、各列がサンプル名からなる遺伝子発現行列を視覚化する手法の一つとしてヒートマップを用いる方法がある。R では、ヒートマップを描く関数として、標準的な heatmap や heatmap.2 の関数の他に、生物学に特化した. フォーマットさえ揃えれば、大きな .txt や .csvファイルでもヒートマップを描けます。では、Rにデータを読み込みます。 > data <- read.delim("clockdemo.txt", header=TRUE, row.names=1) csvファイルの場合には、 > data<-read.csv("clockdemo.csv", header = TRUE, row.names = 1). Seabornを利用して簡単にヒートマップを作成する方法を紹介します。ついでに、全columnに対する相関係数の作成方法も扱います。データセットとしては、Bike Sharing Data Setを利用します。UCI Bike Sharin.

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